В конце прошлого века С. М. Виноградским было установлено, что некоторые микроорганизмы могут добывать необходимую для жизни энергию путем окисления минеральных соединений. Эти организмы были названы автотрофами или хемоавтотрофами.
В пахотном горизонте на 1 га живая масса бактерий составляет
Гумус — отличный хранитель элементов питания и влаги. При засухе накопленная влага используется растениями. Микроорганизмы развиваются лучше при влажности, равной 50-60% от полной влагоемкости.
Органический азот не усваивается растениями, поэтому аммонификаторы являются основным поставщиком аммонийного азота для растений. В процессе аммонификации принимают участие бактерии, актиномицеты, грибы. Используются белки, аминосахара, нуклеиновые кислоты, пуриновые основания, мочевина; труднее аммонифицируются гумусовые вещества. Аммиак частично адсорбируется в глинистых минералах и веществах гумусовых частиц или нейтрализует кислотность почвы, часть его идет на построение клеток микробов и грибов; часть окисляется в нитраты, нитриты (автотрофами), а некоторое количество свободного аммиака выделяется в атмосферу.
Очень важное значение имеет процесс нитрификации — окисление аммиачных солей до нитратов. Нитраты также важнейший источник азота для растений. Большое влияние на содержание нитратов в почве оказывает влажность и рН среды. Сохранению нитратов способствует правильная обработка почвы, создающая благоприятную влажность и циркуляцию воздуха. Образование нитратов идет при температуре